\documentclass[
    smallheadings,      % kleinere Überschriften
    oneside,            % einseitig, nur rechte Seiten
    liststotoc,         % Listen in Inhaltsverzeichnis aufnehmen
    bibtotoc,           % Literaturverzeichnis in Inhaltsverzeichnis. aufnehmen
    headsepline,        % Trennlinie unter Kopfzeile
    12pt
    ]{scrbook}
\usepackage{a4}             % a4 Seitenformat benutzen

\usepackage[ngerman,english]{babel} % Verwende deutsche, bzw. amerikanische Silbentrennung, umschalten mit 										%\selectlanguage{ngerman}
\usepackage[utf8]{inputenc} % Umlaute ganz normal schreiben. (unter Windows latin1 benutzen)

\usepackage{amsmath}
\usepackage{amsfonts}
\usepackage{amssymb}

\usepackage{alltt}

\usepackage[final]{pdfpages} %pdf Dateien einbinden
\usepackage{graphicx}        % zum Einbinden von Grafiken
\graphicspath{{grafiken/}{../}{kapitel/}{kapitel/anhaenge/grafiken/}} % da sind mögliche Bilder für den includegraphics-Befehl zu finden (man muss dann nicht den ganzen Pfad bei includegraphics angeben. 

\usepackage{rotating}		%Text rotieren
\usepackage{framed}
%\usepackage[automark]{scrpage2}     % Paket für Kopf- und Fusszeilen
\usepackage[automark, %Automatische Kopfzeile
            %headtopline,	%Linie über dem Seitenkopf
            %plainheadtopline,%Plain, Linie über dem Seitenkopf
            headsepline,	     %Linie zwischen Kopf und Textkörper
            plainheadsepline,%Plain, Linie zwischen Kopf und Textkörper
            footsepline,		%Linie zwischen Textkörper und Fuß
            plainfootsepline   %Plain, Linie zwischen Textkörper und Fuß
            %footbotline,				%Linie unter dem Fuß
            %plainfootbotline   %Plain, Linie unter dem Fuß
]{scrpage2}
\pagestyle{scrheadings}   % Kopzeilenseitenstil

\pagestyle{scrheadings}   % Kopzeilenseitenstil
\usepackage{setspace}
\usepackage{url}          % fuer urls: schreibweise ist z.B. \url{http://www.switch.ch}
\usepackage{rotating}     % Schriften rotieren
\usepackage[pdftex,       % PDFs mit klickbarem Inhatsverzeichnis erstellen
	colorlinks, 	  % Schrift in Farbe, sonst mit Rahmen
	bookmarksnumbered,% Inhaltsverzeichnis mit Nummerierung
	bookmarksopen, 	  % offnet das Inhaltsverzeichnis
	pdfstartview=FitH,% startet mit Seitenbreite
	linkcolor=black,  % standard red
	citecolor=blue,   % standard green
	urlcolor=blue, % standard cyan
	filecolor=blue 		
]{hyperref}
\usepackage{caption} 	% Caption auch in non-float tabellen/bildern setzen
	%Benutzung: \mycaption{table|figure}{Titel}
	\newcommand{\mycaption}[2]{\begin{minipage}{\textwidth}\captionof{#1}{#2}\end{minipage}}

\setlength{\parindent}{0pt}
\setlength{\parskip}\medskipamount % besser als explizite Angabe in pt

\onehalfspacing

% Kapitelüberschriften in Schriftart mit Serifen
\setkomafont{sectioning}{\normalfont\normalcolor\bfseries}

\automark[section]{chapter}  %Sektion und Kapitel für Headmark
\setheadsepline{.4pt}        %Separate Linie im Kopf
\clearscrheadfoot            %Kopf und Fußzeile löschen
\ohead[\pagemark]{\pagemark} %Seitenzahl im Kopf  -> innen
\ihead[\headmark]{\headmark} %Headmark im Kopf    -> außen

% ----- Ende der Präambel ----------------------------------

\begin{document}  
\selectlanguage{ngerman}        % deutsche Silbentrennung
\frontmatter                    % Vorspann, Kapitel römisch nummeriert
\include{kapitel/titel}         % titelseite einbinden
\include{kapitel/zusammenfassung}%Abstract
\tableofcontents                % Inhaltsverzeichnis
\listoffigures                  % Abbildungsverzeichnis
\listoftables                   % Tabellenverzeichnis
\include{kapitel/abkuerzungen}  % Beispiel eines handerstellten verzeichnisses
\include{kapitel/aufgabenstellung} %Original Aufgabenstellung
\include{kapitel/bestaetigung}
\newpage
\mainmatter                     % Hauptteil, Kapitel lateinisch nummeriert
\include{kapitel/einleitung}
\include{kapitel/gesamtkonzept}
\include{kapitel/verlauf}
\include{kapitel/resultate}
\include{kapitel/ausblick}

%\backmatter                    % Schluss, Literaturverzeichnis
\include{kapitel/bibliografie}	%Literaturverzeichnis

\begin{appendix}
\include{kapitel/anhaenge_blatt}
\include{kapitel/anhaenge/voraussetzungen}
\include{kapitel/anhaenge/software_entwicklung}
\include{kapitel/anhaenge/eclipse}
\include{kapitel/anhaenge/valgrind}
\include{kapitel/anhaenge/pflichtenheft}
\include{kapitel/anhaenge/roadmap}
\include{kapitel/anhaenge/sitzungsprotokolle}

\chapter{Doxygen}\label{chap:doxygen}
Es folgt die mit Doxygen erstelle Dokumentation des Quellcodes.
\includepdf[pages=-]{diverse/refman.pdf}
\end{appendix}

\end{document}